Dział przyrodniczy zaprasza do fascynującej podróży po świecie – nie tylko morskich – zwierząt. „Fauna mórz i oceanów” prezentuje ogromną różnorodność gatunków trzech stref klimatycznych: umiarkowanej, arktycznej i tropikalnej. „Świat żywej rafy koralowej” przenosi nas do królestwa korali, ukwiałów, rozgwiazd i pokolców występujących u wybrzeży Australii, Hawajów czy Malezji.
Kolejna kondygnacja to dział morski. Pełno tu modeli różnego rodzaju statków rybackich i różnych akcesoriów: sieci, saków, bosaków, dzwonów okrętowych oraz rozmaitych pamiątek przywiezionych z morskich wypraw. Uwagę przyciągają również misternie wykonane modele znanych żaglowców. Oczywiście nie mogło zabraknąć wystawy dotyczącej „bałtyckiego złota” (czyli bursztynu).
Dział historyczny zajmuje najwyższą kondygnację muzeum. Ekspozycja poświęcona jest historii miasta i jego kulturze materialnej. Wrażenie robi bardzo bogata kolekcja ceramiki – w dużej mierze przedwojennej – związanej ze Świnoujściem. A dla chętnych – wirtualny spacer po alejkach i deptakach przedwojennego uzdrowiska.
Gdyby ktoś jeszcze nie wiedział „gdzie jest Nemo”, powinien odwiedzić Muzeum Rybołówstwa.